工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次(cì )追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时(shí )不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发(fā )现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！