工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一(yī )找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被(bèi )小兰(lán )撞见(jiàn )的(de )新一情急(jí )之下编造了自己名(míng )叫(jiào )江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了(le )小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一名(míng )私家侦探，新一可(kě )以(yǐ )籍着(zhe )和他(tā )一起四出办案一起追(zhuī )查(chá )黑夜人的下落。柯(kē )南在(zài )小学认识步(bù )美等(děng )小学生(shēng )，他(tā )们(men )一起组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！