工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了(le )神(shén )奇的药(yào )水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到(dào )了经(jīng )常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行(háng )报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希(xī )望能得到解(jiě )药。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯(kē )南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新(xīn )一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在(zài )小学(xué )认识步美等(děng )小学生，他们(men )一(yī )起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪(zuì )犯宣战！