工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯(fàn )罪(zuì )团伙时不(bú )幸被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞(zhuàng )见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查(chá )黑(hēi )夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们(men )一起组织(zhī )了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！