工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙(huǒ )成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博士，博士为他度(dù )身打造(zào )不少间(jiān )谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中(zhōng )追查他们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰(lán )来到了(le )阿笠博士的家寻(xún )找(zhǎo )男友的(de )下落(luò )，被小兰(lán )撞(zhuàng )见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯(kē )南寄(jì )居在了(le )小兰家(jiā )。小兰(lán )的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案(àn )一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们(men )一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！