工(gōng )藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不(bú )少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查(chá )他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿(ā )笠博士的(de )家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见的(de )新一情急之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江户(hù )川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是(shì )一名私家侦探，新一(yī )可(kě )以籍着和他一起(qǐ )四(sì )出办案(àn )一起追查黑(hēi )夜人的下(xià )落。柯(kē )南在小学(xué )认识步美(měi )等小学生，他(tā )们(men )一起组织了一个少年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣战(zhàn )！