工(gōng )藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时不(bú )幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一(yī )变(biàn )回了(le )小孩(hái )！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对(duì )他(tā )进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能(néng )得到(dào )解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的(de )家寻(xún )找男友(yǒu )的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一起追(zhuī )查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！