工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打造(zào )不少间(jiān )谍武器。为(wéi )了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查(chá )他们(men )，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰(lán )的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一(yī )起四出(chū )办案一起追(zhuī )查黑夜(yè )人的下落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦(zhēn )探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣战！