工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小(xiǎo )孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为(wéi )他度(dù )身打造不(bú )少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙对(duì )他进(jìn )行报复，新一(yī )决定隐姓埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯(kē )南寄居(jū )在(zài )了小兰(lán )家。小兰的(de )父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在(zài )小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！