工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发(fā )现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博(bó )士(shì )的家寻找男友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰(lán )撞见的新一情急之下(xià )编造了自(zì )己名叫(jiào )江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一(yī )起(qǐ )四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！