工(gōng )藤新一是全(quán )国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博(bó )士为他(tā )度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武(wǔ )器(qì )。为(wéi )了(le )防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对他(tā )进(jìn )行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得(dé )到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻(xún )找男友的下落(luò )，被小兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在(zài )了(le )小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他(tā )们(men )一起组织了一(yī )个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！