工藤新一是全国著名(míng )的(de )高中生(shēng )侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇的药水(shuǐ )，工藤新(xīn )一变回了(le )小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不(bú )少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿(ā )笠(lì )博士的家寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学(xué )生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！