工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时(shí )不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇(qí )的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一(yī )情急之(zhī )下编造了自(zì )己名叫江户川(chuān )柯(kē )南(nán )，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是(shì )一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯南(nán )在小学(xué )认识步(bù )美等小学生，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！