工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩！新一(yī )找到(dào )了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他(tā )进(jìn )行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的(de )家寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一(yī )情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南(nán )寄居在了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家(jiā )侦探，新一可(kě )以籍(jí )着和他一起四出办案(àn )一起追查(chá )黑夜(yè )人的(de )下落。柯南在小学认识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！