工藤新一(yī )是全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了(le )神奇的药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他(tā )度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男(nán )友的(de )下落(luò )，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自(zì )己名叫江户(hù )川柯南，随(suí )后柯南寄(jì )居在了(le )小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和(hé )他一(yī )起四(sì )出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦(zhēn )探(tàn )团，向罪犯宣战(zhàn )！