工藤(téng )新(xīn )一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成(chéng )员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他(tā )的阿笠博(bó )士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进(jìn )行(háng )报复，新一决定隐(yǐn )姓埋(mái )名，暗中追查他们，希(xī )望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一情急之下编造了自(zì )己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出(chū )办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组(zǔ )织了(le )一个(gè )少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！