工藤(téng )新一(yī )是全国著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的(de )药(yào )水，工(gōng )藤(téng )新一变回了(le )小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进(jìn )行(háng )报复(fù )，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到了(le )阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见的新一情急(jí )之下编造了自(zì )己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛(máo )利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了(le )一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！