工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打造不(bú )少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对(duì )他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到(dào )了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯(kē )南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名(míng )私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人(rén )的下落(luò )。柯南在(zài )小学认识步美等小学(xué )生，他们一(yī )起(qǐ )组织了(le )一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！