工藤新一是全国著(zhe )名的(de )高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯(fàn )罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新(xīn )一变回(huí )了小孩！新一(yī )找到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一(yī )日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出(chū )办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他(tā )们一起组织了(le )一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣(xuān )战！