工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武器。为(wéi )了防止犯罪团伙(huǒ )对他进(jìn )行报复，新一(yī )决定隐姓埋名(míng )，暗中追查(chá )他们，希望能得到(dào )解(jiě )药(yào )。一(yī )日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠(lì )博(bó )士(shì )的家寻找男友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰撞见(jiàn )的新一情急之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南(nán )寄(jì )居在了(le )小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！