工藤新一是(shì )全(quán )国著(zhe )名的(de )高中生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸(xìng )被团伙成员(yuán )发现，击晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不(bú )少间(jiān )谍(dié )武器(qì )。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起(qǐ )追(zhuī )查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！