工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣(yī )人犯罪团伙时不(bú )幸(xìng )被团伙成员发(fā )现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新(xīn )一变回了小孩！新一找到了(le )经常(cháng )帮助(zhù )他的(de )阿笠博士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武器。为(wéi )了(le )防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急之下编(biān )造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私(sī )家(jiā )侦探(tàn )，新一可以籍着和他(tā )一起四(sì )出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦(zhēn )探(tàn )团，向罪犯宣战！