工藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不(bú )幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为(wéi )他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药(yào )。一日，新(xīn )一 的女(nǚ )友毛利(lì )兰(lán )来(lái )到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之下编造(zào )了自己名(míng )叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个(gè )少(shǎo )年侦(zhēn )探(tàn )团，向(xiàng )罪犯宣战！