工藤新一(yī )是全国(guó )著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑(hēi )衣(yī )人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对他(tā )进(jìn )行报复(fù )，新一决(jué )定隐姓埋(mái )名，暗中追查(chá )他们(men )，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私(sī )家侦(zhēn )探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！