工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成员发现，击(jī )晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希(xī )望能得到(dào )解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了(le )阿笠博(bó )士(shì )的(de )家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰(lán )家。小(xiǎo )兰的父(fù )亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起(qǐ )四(sì )出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了(le )一(yī )个少年侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯宣战！