工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利(lì )兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找男友的(de )下落，被小兰(lán )撞(zhuàng )见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫(jiào )江户(hù )川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私(sī )家侦(zhēn )探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他(tā )们一起(qǐ )组织了(le )一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！