工藤新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人(rén )犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他(tā )进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得(dé )到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻(xún )找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编(biān )造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜人的(de )下落。柯(kē )南在小学(xué )认识步美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一(yī )起(qǐ )组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！