工藤新一是全国著(zhe )名的(de )高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇(qí )的药水，工藤新一变(biàn )回了(le )小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查(chá )他们，希望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞(zhuàng )见的新一(yī )情(qíng )急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍着和他一(yī )起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！