工藤(téng )新一(yī )是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得到解(jiě )药(yào )。一日，新一 的女友毛利(lì )兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父(fù )亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新一(yī )可以(yǐ )籍着和他一起四出(chū )办案(àn )一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等(děng )小学生，他们(men )一(yī )起(qǐ )组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！