工藤(téng )新一是(shì )全国著名(míng )的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新(xīn )一(yī )决定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新(xīn )一 的女友(yǒu )毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是(shì )一名私家(jiā )侦探，新(xīn )一可以籍着和他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了(le )一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！