工藤新一(yī )是全国著名(míng )的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发现，击晕(yūn )后喂了神(shén )奇的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为(wéi )他度身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能(néng )得到解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士(shì )的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案(àn )一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一(yī )个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣(xuān )战！