工藤新一是(shì )全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人(rén )犯(fàn )罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被(bèi )团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了(le )神(shén )奇(qí )的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探(tàn )，新一可(kě )以籍着(zhe )和他一起四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下(xià )落。柯南(nán )在(zài )小学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个(gè )少年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！