工藤(téng )新一是全国著名的高中(zhōng )生侦(zhēn )探，在一次(cì )追(zhuī )查黑(hēi )衣(yī )人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防(fáng )止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠(lì )博(bó )士的家寻找男(nán )友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造(zào )了(le )自(zì )己名叫江(jiāng )户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了(le )小兰(lán )家(jiā )。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他(tā )们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！