工藤新(xīn )一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到(dào )了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打(dǎ )造(zào )不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防(fáng )止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被小(xiǎo )兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛(máo )利小五郎是一名私(sī )家(jiā )侦探，新一可以籍(jí )着和他(tā )一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪(zuì )犯宣战！