工藤新(xīn )一是(shì )全国著名的高中(zhōng )生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他(tā )们，希(xī )望能得到解药(yào )。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父(fù )亲(qīn )毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣战！