工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇(qí )的药(yào )水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小(xiǎo )孩！新一(yī )找(zhǎo )到了经(jīng )常帮助他的阿(ā )笠博(bó )士，博(bó )士(shì )为他度身打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗(àn )中追查(chá )他(tā )们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们(men )一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！