工(gōng )藤新一是全国著名(míng )的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不(bú )少间谍(dié )武器(qì )。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决(jué )定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一(yī )日，新一 的(de )女(nǚ )友毛利兰来(lái )到了阿笠博(bó )士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄(jì )居在(zài )了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一起四(sì )出办(bàn )案一起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯(kē )南在小学(xué )认识步美等小学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！