工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤(téng )新一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙对(duì )他进行报复，新(xīn )一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来(lái )到(dào )了阿笠(lì )博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认识(shí )步美等小学生，他们(men )一起组(zǔ )织了(le )一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！