工藤新一是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不(bú )幸(xìng )被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇(qí )的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打(dǎ )造不(bú )少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编(biān )造(zào )了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小(xiǎo )兰(lán )的(de )父亲毛利小(xiǎo )五郎(láng )是一名私(sī )家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣(xuān )战！