工藤新一(yī )是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人(rén )犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员(yuán )发(fā )现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身(shēn )打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了(le )防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复(fù )，新一(yī )决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰(lán )来到(dào )了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己(jǐ )名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认(rèn )识(shí )步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！