工藤(téng )新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神(shén )奇的药(yào )水，工(gōng )藤新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间(jiān )谍武器。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的(de )下(xià )落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急(jí )之下编造了自(zì )己名(míng )叫(jiào )江户川(chuān )柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名(míng )私家(jiā )侦探，新(xīn )一可以籍着和他一(yī )起四出办(bàn )案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣(xuān )战！