工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠(lì )博(bó )士，博士为他度(dù )身打造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他(tā )进行报复(fù )，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查(chá )他们，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随(suí )后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追查(chá )黑夜(yè )人的下落(luò )。柯南在小学认识(shí )步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少(shǎo )年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！