工藤(téng )新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为他度(dù )身打造不(bú )少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对(duì )他进(jìn )行报复(fù )，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下(xià )落(luò )，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自(zì )己名叫江户川(chuān )柯南，随(suí )后柯南(nán )寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小(xiǎo )兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识(shí )步美等(děng )小学生(shēng )，他们(men )一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！