工(gōng )藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍(dié )武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复(fù )，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找(zhǎo )男友的下(xià )落(luò )，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰家(jiā )。小(xiǎo )兰的父亲(qīn )毛利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！