工藤新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中(zhōng )追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了(le )小兰(lán )家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一(yī )名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学认识步美等小(xiǎo )学生，他们(men )一起组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！