工藤新一是全国著名的(de )高中生侦(zhēn )探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸(xìng )被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进(jìn )行(háng )报复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男(nán )友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之下编造了自己名(míng )叫(jiào )江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私(sī )家(jiā )侦(zhēn )探，新一(yī )可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学(xué )认识步美等小学(xué )生，他(tā )们一起组织了一个少(shǎo )年(nián )侦探团，向罪犯宣战！