工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙(huǒ )时不幸被团(tuán )伙成员(yuán )发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博(bó )士，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决(jué )定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的家(jiā )寻找男友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下(xià )落。柯南(nán )在小学认识步美等(děng )小学生，他们(men )一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！