工(gōng )藤(téng )新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一(yī )次追查黑(hēi )衣人犯罪团(tuán )伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博(bó )士为(wéi )他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他(tā )进行报复(fù )，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药(yào )。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了(le )小兰(lán )家。小兰的父(fù )亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认识(shí )步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！