工(gōng )藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来(lái )到了阿笠博士(shì )的家(jiā )寻找(zhǎo )男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造(zào )了(le )自己名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四(sì )出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了(le )一(yī )个(gè )少年(nián )侦探(tàn )团，向罪犯宣战！