工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在(zài )一次(cì )追查黑衣(yī )人犯罪团伙时(shí )不幸被(bèi )团伙成员(yuán )发现，击晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变回(huí )了小孩！新一找到(dào )了经(jīng )常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为(wéi )他度身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报(bào )复，新一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的下落(luò )，被小兰撞见的新一(yī )情急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在(zài )了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私(sī )家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起(qǐ )追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！